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Logiciel comptable pour petites entreprises : 8 critères

Deux entrepreneurs, une même question : quel logiciel comptable me convient ? La réponse dépend moins du prix que de la forme juridique et de ce qui se passe vraiment au quotidien. Ces huit critères t'aident à voir ce dont tu as besoin et ce que tu ne devrais pas payer.

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Rédaction einzly
Rédaction fiscale & financière · einzly
5 min de lecture
22 oct. 2026
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Logiciel comptablePetites entreprisesEntreprise individuelleSàrl

Marco est graphiste avec sa propre entreprise individuelle : 80'000 francs de chiffre d'affaires, pas d'employés. Sandra dirige une Sàrl avec deux collaborateurs et est assujettie à la TVA depuis l'an dernier. Tous deux cherchent un logiciel comptable et comparent les prix. (Ils sont fictifs, la situation est typique.)

Le problème : ils ne comparent pas la bonne chose. Pour Marco, un logiciel avec module salaires et paiements groupés aux fournisseurs serait de l'argent jeté par la fenêtre. Sandra, elle, ne bouclera pas ses comptes annuels avec un simple outil recettes-dépenses. Avant de comparer les prix, clarifie donc ce dont ton entreprise a besoin.

01D'abord la forme juridique

La forme juridique détermine quelle comptabilité tu dois tenir (art. 957 CO) :

  • Entreprise individuelle ou société en nom collectif avec moins de CHF 500'000 de chiffre d'affaires : il suffit d'enregistrer les recettes, les dépenses et la situation patrimoniale. C'est la comptabilité recettes-dépenses dont Marco a besoin.
  • Entreprise individuelle dès CHF 500'000 de chiffre d'affaires : comptabilité en partie double avec bilan et compte de résultat.
  • Sàrl et SA : toujours la comptabilité en partie double, dès le premier franc. C'est le cas de Sandra.

Tu hésites sur la forme juridique ? La comparaison des formes juridiques t'aide. Ce que comprend la comptabilité simple est expliqué dans le compte recettes-dépenses.


02Les 8 critères

1. Le logiciel fait-il ce que ta forme juridique exige ?

Pour Marco, un compte recettes-dépenses léger est idéal. Plus de comptabilité, c'est juste plus de travail. Sandra a besoin du débit et du crédit, d'un plan comptable selon le plan comptable PME suisse et, en fin d'année, d'un bilan et d'un compte de résultat. Vérifie que tu pourras évoluer plus tard sans repartir de zéro, si ton entreprise individuelle grandit ou si tu fondes une Sàrl.

2. La TVA est-elle simple ?

Dès CHF 100'000 de chiffre d'affaires annuel, ton entreprise est assujettie à la TVA. Tu décomptes alors chaque trimestre avec la méthode effective, ou chaque semestre avec le taux de la dette fiscale nette. Un bon logiciel connaît les deux méthodes, calcule le décompte et crée un fichier que tu téléverses sur le portail de l'AFC. Si tu n'es pas (encore) assujetti, le logiciel ne devrait pas t'imposer le sujet.

3. Factures QR et paiements reçus

La facture QR est le standard en Suisse. Plus important que de la créer, c'est la suite : le logiciel reconnaît-il quelle facture a été payée ? Le plus simple est d'importer le fichier bancaire (camt) et de laisser le logiciel attribuer les paiements aux factures ouvertes. Tu vois d'un coup d'œil qui n'a pas encore payé et tu peux relancer de manière ciblée.

4. Justificatifs et factures fournisseurs

Chaque écriture a besoin d'un justificatif, et tu conserves les justificatifs dix ans. Le format numérique est autorisé. Vérifie donc si tu peux saisir les quittances en photo avec ton téléphone et si le logiciel les archive en sécurité. Avec des employés et de nombreux fournisseurs, la gestion des créanciers devient importante : saisir les factures, suivre les échéances et les payer en une fois avec un fichier e-banking. Marco n'en a guère besoin, Sandra y gagne du temps chaque mois.

5. Salaires et AVS

En entreprise individuelle, tu paies les cotisations AVS en tant qu'indépendant ; une comptabilité salariale n'est nécessaire qu'avec des employés. Dans une Sàrl, c'est différent : qui y travaille est salarié, toi aussi en tant que propriétaire. Les fiches de salaire, les déductions AVS et la déclaration annuelle des salaires en font alors partie. Que cela se fasse dans le logiciel comptable ou dans un programme de salaires séparé est secondaire. L'important est que les écritures de salaires arrivent correctement dans la comptabilité.

6. Accès pour la fiduciaire

Beaucoup de petites entreprises tiennent elles-mêmes leur comptabilité et confient les comptes annuels ou la déclaration d'impôt à une fiduciaire. Cela ne fonctionne bien que si la fiduciaire peut consulter directement le logiciel, au lieu de recevoir des classeurs et des listes Excel. Demande : existe-t-il un accès dédié pour la fiduciaire, et coûte-t-il un supplément ?

7. Où sont tes données ?

Ta comptabilité contient des noms de clients, des salaires et des coordonnées bancaires. Demande où les données sont stockées et si tu peux les exporter entièrement à tout moment, par exemple en Excel ou en PDF. Un export est aussi ton assurance si tu changes un jour de logiciel.

8. Combien ça coûte vraiment ?

Le prix d'entrée ne dit pas grand-chose. Les pièges se cachent dans les petites lignes :

  • Modules : TVA, salaires, connexion bancaire ou rappels sont facturés en plus.
  • Utilisateurs : chaque personne supplémentaire, fiduciaire comprise, coûte une licence.
  • Justificatifs et factures : l'abonnement bon marché n'en permet qu'un nombre limité par mois.
  • Changement : reprendre ou exporter les données coûte de l'argent ou est impossible.

Calcule donc avec le prix que tu paieras la deuxième année, avec tout ce dont tu as besoin.


03Comment choisir

1
Clarifier forme juridique et chiffre d'affaires

Comptabilité simple ou en partie double ? Assujetti à la TVA ou non ? Des employés ou non ?

2
Dresser une liste d'exigences

Parmi les huit critères, garde seulement ceux qui te concernent aujourd'hui ou dans les deux prochaines années.

3
Tester deux ou trois logiciels

La plupart proposent une période d'essai. Saisis de vrais justificatifs et une vraie facture, pas seulement des données de démonstration.

4
Demander à ta fiduciaire

Si tu travailles avec une fiduciaire, demande-lui avec quel logiciel elle est à l'aise.


04Comment einzly t'aide

einzly existe en deux versions, adaptées à Marco et à Sandra :

  • einzly pour entreprises individuelles : factures avec code QR, dépenses par photo de justificatif, rapprochement bancaire, TVA au taux de la dette fiscale nette ou effective, et un compte recettes-dépenses qui facilite ta déclaration d'impôt.
  • einzly Business pour Sàrl et SA : comptabilité en partie double selon le plan comptable PME suisse, créanciers avec fichier de paiement pour l'e-banking, TVA avec export pour le portail de l'AFC, assistant de bouclement. CHF 35 par mois ou CHF 29 en abonnement annuel, hors TVA, tout compris.
  • Pour les deux : accès gratuit pour ta fiduciaire.
Essai de 30 jours, sans carte de créditEntreprise individuelle ? Essayer einzly. Sàrl ou SA ? Essayer einzly Business.

05Sources et bases légales

  • Code des obligations (CO, RS 220) : art. 957, 957a, 958 et 958f (obligation de tenir une comptabilité, comptabilité simple et en partie double, comptes annuels, conservation). Fedlex, consulté le 22.10.2026
  • Loi sur la TVA (LTVA, RS 641.20) : art. 10, 35 et 37 (assujettissement dès CHF 100'000, période de décompte, taux de la dette fiscale nette). Fedlex, consulté le 22.10.2026
  • Loi sur l'AVS (LAVS, RS 831.10) : art. 14 et 51 (perception des cotisations, obligations des employeurs). Fedlex, consulté le 22.10.2026
  • Schweizer Kontenrahmen KMU, Mattle/Helbling/Pfaff, Verlag SKV, 2e édition 2023, p. 15–18 (en allemand)

06Questions fréquentes

En dessous de CHF 500'000 de chiffre d'affaires, un compte recettes-dépenses suffit, en théorie aussi avec Excel. Un logiciel devient utile dès que tu factures régulièrement, que tu es assujetti à la TVA ou que tu veux gagner du temps sur le rapprochement bancaire.
Un logiciel avec comptabilité en partie double, plan comptable selon le plan comptable PME suisse, bilan et compte de résultat. En plus : TVA, créanciers et accès pour la fiduciaire. Un simple outil recettes-dépenses ne suffit pas pour une Sàrl.
Les prix vont de quelques francs à plus de cent francs par mois. Ce qui compte, c'est le prix avec tous les modules, utilisateurs et l'accès fiduciaire dont tu as réellement besoin, pas le prix d'entrée.
Oui, si tu peux exporter toutes tes données. Pour un changement propre, choisis une date de référence, en général le début de l'année, et reprends les soldes d'ouverture et les factures ouvertes.
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